这首诗描绘了一种深秋的萧索景象和诗人内心的哀伤。"山上凉云收，日斜川风止"勾勒出一幅静谧而又有些冷清的山川图景，天气渐凉，太阳西沉，山间的风也逐渐平息。

接下来的"娥皇五十弦，秋深汉江水"则是通过古琴的象征来表达诗人内心的情感。古代传说娥皇是神话中的音乐家，而这里提及五十弦，则可能暗示着对往昔时光的追忆和怀念。而汉江的水随季节的深入而变得更加宽广，象征着时间的流逝和情感的扩散。

"初因无象外，牵感百忧里"表达了诗人由于缺乏某种寄托而导致的情感纠葛，这些情绪积累在心中，无法排解。"霜露结瑶华，烟波劳玉指"则形容秋天的景象，霜露凝结成冰晶般的美丽景致，而诗人却因为弹琴而劳碌自己的手指，从中可见诗人内心的哀愁和外界环境的冷淡形成对比。

"将随落叶去，又绕疏蘋起"表达了诗人想要随着秋天的落叶消逝，但又不得不面对现实生活中的种种困顿和忧虑。"哀响云合来，清馀桐半死"则是描写诗人的琴声悲壮而又凄凉，与天空中聚散的云朵相呼应，而那桐树似乎也因为秋风的吹拂而变得摇摇欲坠。

"女颜万岁后，岂复婵娟子"此句表达了对美好事物不再的感慨，即便是美丽如女子的容颜，也随着时间的流逝而失去，而那曾经令人心动的美好也许永远无法再现。

最后"不道神无悲， 那能久如此。魂魄无不之，九山徒相似。没没竟不从，唯伤远人耳。斑斑泪篁下，恐有学瑟鬼"则是诗人的自我慰藉和内心的挣扎。他感叹神明也会对世间的悲凉感到难过，但自己的魂魄却在九山之中彷徨，没有不去的地方，这种孤独和漂泊令人伤感。泪水如溪流般不断，诗人害怕自己是否已经被这种哀愁所困扰。

整首诗通过对自然景象的描绘，以及古琴的象征意义，表达了诗人对于时间流逝、美好事物不再以及个人命运的无奈和悲凉。